Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms