Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms