Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med16Q6PGF3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms