Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms