Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms