Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6PD19 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6PD19 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6PD19 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6PD19 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6PD19 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6PD19 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6PD19 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6PD19 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6PD19 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6PD19 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6PD19 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q6PD19 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q6PD19 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6PD19 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6PD19 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6PD19 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6PD19 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6PD19 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6PD19 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6PD19 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6PD19 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6PD19 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6PD19 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6PD19 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6PD19 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6PD19 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6PD19 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6PD19 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6PD19 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6PD19 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6PD19 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6PD19 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6PD19 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6PD19 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6PD19 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6PD19 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6PD19 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6PD19 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6PD19 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6PD19 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6PD19 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6PD19 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6PD19 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6PD19 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6PD19 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6PD19 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6PD19 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6PD19 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6PD19 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6PD19 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6PD19 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6PD19 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6PD19 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6PD19 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6PD19 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6PD19 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6PD19 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6PD19 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms