Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2mQ6P6I6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2mQ6P6I6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms