Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nwd2Q6P5U7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nwd2Q6P5U7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms