Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrimpolQ6P1E7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrimpolQ6P1E7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrimpolQ6P1E7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrimpolQ6P1E7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrimpolQ6P1E7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrimpolQ6P1E7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrimpolQ6P1E7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrimpolQ6P1E7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrimpolQ6P1E7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrimpolQ6P1E7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrimpolQ6P1E7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrimpolQ6P1E7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PrimpolQ6P1E7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrimpolQ6P1E7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms