Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Paxip1Q6NZQ4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Paxip1Q6NZQ4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms