Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP1

Zranb3, DNA annealing helicase and endonuclease ZRANB3, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zranb3Q6NZP1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zranb3Q6NZP1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zranb3Q6NZP1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms