Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf6Q6NVF9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms