Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV72

Wdcp, WD repeat and coiled-coil-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WdcpQ6NV72 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
WdcpQ6NV72 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WdcpQ6NV72 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms