Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SphkapQ6NSW3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SphkapQ6NSW3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SphkapQ6NSW3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SphkapQ6NSW3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SphkapQ6NSW3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SphkapQ6NSW3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SphkapQ6NSW3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SphkapQ6NSW3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms