Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CltbQ6IRU5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms