Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Carmil1Q6EDY6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Carmil1Q6EDY6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Carmil1Q6EDY6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms