Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Usp7Q6A4J8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Usp7Q6A4J8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Usp7Q6A4J8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp7Q6A4J8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
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Usp7Q6A4J8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Usp7Q6A4J8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Usp7Q6A4J8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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Usp7Q6A4J8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp7Q6A4J8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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