Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Cep290Q6A078 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Cep290Q6A078 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Cep290Q6A078 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep290Q6A078 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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