Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmcc1Q69ZZ6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmcc1Q69ZZ6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms