Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2cQ69ZS6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms