Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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