Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PnkdQ69ZP3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms