Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms