Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms