Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CltcQ68FD5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CltcQ68FD5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CltcQ68FD5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CltcQ68FD5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CltcQ68FD5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CltcQ68FD5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CltcQ68FD5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CltcQ68FD5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms