Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sbno1Q689Z5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sbno1Q689Z5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms