Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrp9bQ66X22 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms