Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CilpQ66K08 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms