Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Arhgef39Q66JY6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Arhgef39Q66JY6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Arhgef39Q66JY6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Arhgef39Q66JY6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Arhgef39Q66JY6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Arhgef39Q66JY6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Arhgef39Q66JY6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Arhgef39Q66JY6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms