Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clcn1Q64347 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms