Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tbr1Q64336 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tbr1Q64336 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Tbr1Q64336 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Tbr1Q64336 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Tbr1Q64336 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Tbr1Q64336 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Tbr1Q64336 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tbr1Q64336 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tbr1Q64336 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tbr1Q64336 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Tbr1Q64336 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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