Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt12Q64291 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms