Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6eQ64253 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms