Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn4Q62472 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn4Q62472 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn4Q62472 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn4Q62472 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn4Q62472 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn4Q62472 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms