Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vil1Q62468 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Vil1Q62468 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms