Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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