Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcncQ62447 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcncQ62447 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms