Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp4Q62445 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms