Protein–RNA interactions for Protein: Q62384

Zpr1, Zinc finger protein ZPR1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zpr1Q62384 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zpr1Q62384 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zpr1Q62384 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms