Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms