Protein–RNA interactions for Protein: Q62283

Tspan7, Tetraspanin-7, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan7Q62283 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan7Q62283 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan7Q62283 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan7Q62283 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan7Q62283 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan7Q62283 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan7Q62283 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan7Q62283 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan7Q62283 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan7Q62283 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan7Q62283 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan7Q62283 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan7Q62283 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan7Q62283 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan7Q62283 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan7Q62283 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms