Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SypQ62277 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SypQ62277 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SypQ62277 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SypQ62277 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SypQ62277 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SypQ62277 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SypQ62277 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SypQ62277 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SypQ62277 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SypQ62277 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SypQ62277 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SypQ62277 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SypQ62277 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SypQ62277 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SypQ62277 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SypQ62277 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SypQ62277 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SypQ62277 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SypQ62277 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SypQ62277 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SypQ62277 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SypQ62277 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SypQ62277 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SypQ62277 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SypQ62277 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SypQ62277 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SypQ62277 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SypQ62277 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SypQ62277 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SypQ62277 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms