Protein–RNA interactions for Protein: Q62245

Sos1, Son of sevenless homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sos1Q62245 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sos1Q62245 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sos1Q62245 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms