Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssr4Q62186 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms