Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms