Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SspnQ62147 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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