Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3bQ62141 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms