Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrxQ61687 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms