Protein–RNA interactions for Protein: Q61686

Cbx5, Chromobox protein homolog 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx5Q61686 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx5Q61686 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx5Q61686 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx5Q61686 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx5Q61686 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx5Q61686 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx5Q61686 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx5Q61686 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx5Q61686 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx5Q61686 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx5Q61686 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx5Q61686 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx5Q61686 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx5Q61686 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx5Q61686 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx5Q61686 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx5Q61686 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms