Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms